2 Colaboraciones de intercambio de datos
A medida que el número de secuencias publicadas incrementó, el flujo de trabajo cambió: abriendo discusiones con los publicadores de literatura científica, las organizaciones detrás de estas bases de datos convencieron a los publicadores de que le pidieran a los investigadores enviar sus secuencias a una base de datos pública antes de someter un artículo. A cambio, a los autores se les otorga un número de acceso que pueden citar luego en el artículo. Este modelo ha sido seguido por muchos proveedores de datos biológicos públicos. La Tabla 1 provee algunos ejemplos significativos.
El otro aspecto importante de estas colaboraciones es que sus participantes intercambian datos y/o asignan cargas de trabajo de tal forma que se evadan los esfuerzos duplicados mientras que se asegura que los datos están anotados y se hacen disponibles de manera consistente.
Tabla 1. Algunos ejemplos de colaboraciones globales establecidas para gestionar el registro público de diferentes tipos de datos biológicos.
| Tipo de datos | Colaboración |
|---|---|
| Secuencias de nucleótidos | Colaboración Internacional de Bases de datos de Secuencias |
| Secuencias de proteínas | Consorcio UniProt |
| Estructuras de macromoléculas | Banco mundial de datos de proteínas |
| Interacciones moleculares | Consorcio Internacional de Intercambio Molecular |
| Identificaciones de proteínas | Consorcio ProteomeXchange |
| Datos genómicos y clínicos | Alianza Global para la Genómica y la Salud |
2.1 ¿A quién le pertenecen los datos?
Desde sus inicios, la comunidad de bioinformática ha defendido el intercambio abierto de datos, y lo hizo una realidad a través de colaboraciones tales como las resumidas en la Tabla 1. Esta política abierta ha permitido que la comunidad de investigadores haga un buen uso de los datos que emergen de grandes proyectos internacionales tales como el Proyecto Genoma Humano (2001) y el proyecto Encode. Sin embargo, es importante tener en cuenta que el intercambio abierto de datos no es solo para estas grandes colaboraciones. Retos recientes en las políticas de financiamiento han empezado a reflejar la visión ampliamente sostenida hoy en día de que, si se gasta dinero público en investigación (en cualquier área), los datos de esa investigación deberían estar disponibles públicamente para que otros los usen.