La bioinformática como una ciencia experimental
La bioinformática no es solo sobre almacenar datos en bases de datos, también es sobre hacer experimentos con esos datos. Encontrar una entrada en la que estás interesado en una base de datos es una búsqueda en bases de datos, pero tan pronto como quieras sacar una conclusión de tu búsqueda (inferir cuáles son los homólogos de una proteína de interés por ejemplo) estás haciendo un experimento y necesitas aplicar las mismas metodologías científicas en términos de controles, etc. que usarías en un experimento en el laboratorio.
También es importante que tomes una decisión informada cuando decidas qué método computacional usar, y que entiendas las ventajas y limitaciones del método que estás usando.
Tipos de experimentos en bioinformática
Hemos explorado cómo los datos bioinformáticos son almacenados y cómo están estructurados y anotados. Ahora aprenderemos cómo puedes obtener los datos y cómo podrías usarlos para informar el proceso de descubrimiento científico.
Existen un gran número de técnicas para analizar grandes cantidades de datos biológicos. En este curso trataremos las principales bases de datos como una puerta de entrada a la literatura científica con datos adicionales y estructurados para ayudarte a realizar búsquedas más sistemáticas de las que podrías realizar usando solo una base de datos de literatura.
Como parte de eso, en las siguientes secciones consideraremos cuatro tipos diferentes de experimentos bioinformáticos: búsqueda, comparación, modelamiento e integración.